炎炎夏日，為了找到所向披靡的獨角仙，大雄（大原めぐみ 配音）痛哭流涕，對哆拉A夢（水田わさび 配音）軟磨硬泡。無奈之下，哆拉A夢和哆拉美（千秋 配音）拿出時光圈，幫大雄在500年前的新西蘭尋找獨角仙，誰知卻意外抓到了早已滅絕的恐鳥。為了不至於讓恐鳥走向滅亡，他們決定將其送往奇跡之島。奇跡之島是由未來的科學家開發的專門用來收留、保護、研究滅絕動物的小島，傳說島上有一只黃金獨角仙，它可為當地的生物注入生命的力量。一波三折，大雄和小伙伴們來到了這裡，並且結識了和大雄極其相像的神秘少年達凱（野沢雅子 配音）以及善良的洛科洛族。與此同時，一個黑心商人圖謀抓住黃金獨角仙本片為哆拉A夢誕生前100年的紀念之作。